Биотехнология  зертханасы қызметінің негізгі мақсаты – Жетісу өңірінің аграрлық дамуына үлес қосатын микробиологиялық зерттеулерді ұйымдастыру және жүргізу. Қазақстанда микробиологиялық зерттеулердің  өндіріс, экологиялық ортаны қорғау және денсаулық сақтау қатарлы салаларда қолданылуына үлес қосу.